Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms