Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGSNQ5TDP6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGSNQ5TDP6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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