Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RSPH4AQ5TD94 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RSPH4AQ5TD94 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RSPH4AQ5TD94 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms