Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBAP2Q5T6F2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms