Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN3Q5MJ09 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN3Q5MJ09 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN3Q5MJ09 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN3Q5MJ09 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN3Q5MJ09 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN3Q5MJ09 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN3Q5MJ09 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN3Q5MJ09 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN3Q5MJ09 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPANXN3Q5MJ09 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPANXN3Q5MJ09 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPANXN3Q5MJ09 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms