Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms