Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC27A3Q5K4L6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC27A3Q5K4L6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms