Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms