Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZNF628Q5EBL2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF628Q5EBL2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms