Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms