Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COBLL1Q53SF7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms