Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A4Q53GD3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms