Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RFTN2Q52LD8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms