Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms