Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms