Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC1Q4ZHG4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms