Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERKLQ49MI3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms