Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX19Q49B96 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms