Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms