Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-4Q3LI77 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-4Q3LI77 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-4Q3LI77 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms