Protein–RNA interactions for Protein: Q3E827

LSO1, Protein LSO1, yeastyeast

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSO1Q3E827 YER187WYER187W 426 nt5.41□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 TAM41YGR046W 1158 nt5.41□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 MPC3YGR243W 441 nt5.41□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 TDH2YJR009C 999 nt5.41□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 RPC37YKR025W 849 nt5.41□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 SCS22YBL091C-A 528 nt5.41□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.41□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt5.41□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 YPR098CYPR098C 486 nt5.41□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 POF1YCL047C 777 nt5.41□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 IMD2YHR216W 1572 nt5.41□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 SUC2YIL162W 1599 nt5.41□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 YCT1YLL055W 1596 nt5.41□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 MTL1YGR023W 1656 nt5.4□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 RTC5YOR118W 1704 nt5.4□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 PBP4YDL053C 558 nt5.4□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 YDR355CYDR355C 303 nt5.4□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 CNL1YDR357C 369 nt5.4□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt5.4□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.4□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 YHR097CYHR097C 1101 nt5.4□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 RPS1BYML063W 768 nt5.4□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 IMP1YMR150C 573 nt5.4□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 YPL034WYPL034W 498 nt5.4□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 MCM16YPR046W 546 nt5.4□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 PBN1YCL052C 1251 nt5.4□□□□□ -1.54
LSO1Q3E827 KRE2YDR483W 1329 nt5.4□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 HPF1YOL155C 2904 nt5.4□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 CPS1YJL172W 1731 nt5.4□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 MSC7YHR039C 1935 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 IMD3YLR432W 1572 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YCR013CYCR013C 648 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 PRP11YDL043C 801 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 IDP1YDL066W 1287 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 UGX2YDL169C 672 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 BSC2YDR275W 708 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 RPS2YGL123W 765 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 FUR1YHR128W 651 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YJR037WYJR037W 384 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 TPK3YKL166C 1197 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YML003WYML003W 873 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YBL112CYBL112C 318 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 TMC1YOR052C 453 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 RPS10AYOR293W 318 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YGR125WYGR125W 3111 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 PHR1YOR386W 1698 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 NTA1YJR062C 1374 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 KRS1YDR037W 1776 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 ARP4YJL081C 1470 nt5.39□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 MGT1YDL200C 567 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 RPC11YDR045C 333 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 SIP2YGL208W 1248 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 ASG7YJL170C 630 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YLR125WYLR125W 411 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YLR126CYLR126C 756 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 HTA2YBL003C 399 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 GLO1YML004C 981 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 ATG3YNR007C 933 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YOR105WYOR105W 327 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YPR170CYPR170C 336 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 SSY5YJL156C 2100 nt5.38□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 DSL1YNL258C 2265 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 APL6YGR261C 2430 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 GDB1YPR184W 4611 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YDL057WYDL057W 987 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YGR190CYGR190C 366 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 ATG10YLL042C 504 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 TOM22YNL131W 459 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 RHO5YNL180C 996 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 MSN1YOL116W 1149 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YPL088WYPL088W 1029 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 TRK2YKR050W 2670 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 SSZ1YHR064C 1617 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 HCM1YCR065W 1695 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 MCM3YEL032W 2916 nt5.37□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 MAG2YLR427W 2013 nt5.36□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 VMA8YEL051W 771 nt5.36□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 IES5YER092W 378 nt5.36□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YJR012CYJR012C 624 nt5.36□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YNL285WYNL285W 372 nt5.36□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YBR012CYBR012C 420 nt5.36□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 snR24snR24 89 nt5.36□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 TRM11YOL124C 1302 nt5.36□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 RKM2YDR198C 1440 nt5.36□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 RSC58YLR033W 1509 nt5.36□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 AFR1YDR085C 1863 nt5.36□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 UBP10YNL186W 2379 nt5.36□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 YDL218WYDL218W 954 nt5.35□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 SCS2YER120W 735 nt5.35□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 SOP4YJL192C 705 nt5.35□□□□□ -1.55
LSO1Q3E827 PIR3YKL163W 978 nt5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.2 ms