Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NBPF1Q3BBV0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NBPF1Q3BBV0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NBPF1Q3BBV0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NBPF1Q3BBV0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NBPF1Q3BBV0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NBPF1Q3BBV0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NBPF1Q3BBV0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NBPF1Q3BBV0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms