Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms