Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VMACQ2NL98 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VMACQ2NL98 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms