Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTC1Q2NKJ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTC1Q2NKJ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms