Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms