Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIST2H2ACQ16777 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIST2H2ACQ16777 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms