Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX1AQ16623 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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