Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FXNQ16595 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FXNQ16595 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FXNQ16595 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FXNQ16595 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FXNQ16595 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FXNQ16595 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FXNQ16595 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FXNQ16595 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FXNQ16595 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FXNQ16595 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FXNQ16595 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FXNQ16595 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FXNQ16595 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FXNQ16595 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FXNQ16595 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FXNQ16595 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FXNQ16595 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FXNQ16595 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FXNQ16595 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FXNQ16595 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FXNQ16595 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FXNQ16595 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FXNQ16595 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FXNQ16595 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FXNQ16595 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FXNQ16595 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FXNQ16595 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FXNQ16595 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FXNQ16595 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FXNQ16595 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FXNQ16595 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FXNQ16595 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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