Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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