Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms