Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHBQ15464 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHBQ15464 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHBQ15464 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHBQ15464 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHBQ15464 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHBQ15464 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHBQ15464 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHBQ15464 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHBQ15464 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHBQ15464 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHBQ15464 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHBQ15464 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHBQ15464 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHBQ15464 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHBQ15464 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHBQ15464 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHBQ15464 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHBQ15464 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHBQ15464 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHBQ15464 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHBQ15464 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHBQ15464 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHBQ15464 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHBQ15464 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHBQ15464 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SHBQ15464 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHBQ15464 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SHBQ15464 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SHBQ15464 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SHBQ15464 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SHBQ15464 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHBQ15464 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHBQ15464 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHBQ15464 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHBQ15464 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHBQ15464 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHBQ15464 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHBQ15464 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHBQ15464 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHBQ15464 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHBQ15464 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHBQ15464 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHBQ15464 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHBQ15464 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHBQ15464 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHBQ15464 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SHBQ15464 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHBQ15464 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHBQ15464 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHBQ15464 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHBQ15464 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHBQ15464 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHBQ15464 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHBQ15464 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SHBQ15464 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHBQ15464 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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