Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3A2Q15428 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SF3A2Q15428 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SF3A2Q15428 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3A2Q15428 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SF3A2Q15428 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3A2Q15428 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3A2Q15428 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3A2Q15428 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SF3A2Q15428 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SF3A2Q15428 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SF3A2Q15428 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SF3A2Q15428 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SF3A2Q15428 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SF3A2Q15428 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SF3A2Q15428 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SF3A2Q15428 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SF3A2Q15428 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SF3A2Q15428 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3A2Q15428 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3A2Q15428 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3A2Q15428 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3A2Q15428 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3A2Q15428 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3A2Q15428 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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