Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTF1Q15361 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
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