Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NKX1-1Q15270 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms