Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
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