Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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