Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
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