Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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