Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB33AQ14088 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB33AQ14088 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB33AQ14088 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB33AQ14088 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB33AQ14088 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB33AQ14088 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB33AQ14088 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB33AQ14088 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB33AQ14088 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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RAB33AQ14088 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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RAB33AQ14088 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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RAB33AQ14088 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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RAB33AQ14088 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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RAB33AQ14088 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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RAB33AQ14088 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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RAB33AQ14088 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
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RAB33AQ14088 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB33AQ14088 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB33AQ14088 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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