Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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