Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3CQ13748 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3CQ13748 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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