Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTCH1Q13635 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
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