Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 KIF20A-202ENST00000502338 600 ntTSL 34.28□□□□□ -1.722e-7■■■□□ 15
TRA2AQ13595 RSRP1-210ENST00000564223 395 ntTSL 33.62□□□□□ -1.833e-8■■■□□ 15
TRA2AQ13595 RSRP1-221ENST00000569495 901 ntTSL 23.01□□□□□ -1.933e-8■■■□□ 15
TRA2AQ13595 SRRM2-224ENST00000575870 696 ntTSL 310.04□□□□□ -0.81e-12■■■□□ 15
TRA2AQ13595 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.342e-9■■■□□ 15
TRA2AQ13595 HNRNPU-212ENST00000638230 1922 ntTSL 510.23□□□□□ -0.772e-9■■■□□ 15
TRA2AQ13595 HNRNPU-221ENST00000639824 1450 ntTSL 510.2□□□□□ -0.782e-9■■■□□ 15
TRA2AQ13595 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 58.8□□□□□ -12e-9■■■□□ 15
TRA2AQ13595 HNRNPU-202ENST00000366525 2851 ntTSL 58.55□□□□□ -1.042e-9■■■□□ 15
TRA2AQ13595 HNRNPU-216ENST00000638716 2640 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.12e-9■■■□□ 15
TRA2AQ13595 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.192e-9■■■□□ 15
TRA2AQ13595 HNRNPU-222ENST00000639880 4239 ntTSL 57.34□□□□□ -1.242e-9■■■□□ 15
TRA2AQ13595 HNRNPU-207ENST00000468690 5273 ntTSL 57.14□□□□□ -1.272e-9■■■□□ 15
TRA2AQ13595 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.312e-9■■■□□ 15
TRA2AQ13595 HNRNPU-213ENST00000638301 3650 ntTSL 55.73□□□□□ -1.492e-9■■■□□ 15
TRA2AQ13595 CCAR1-205ENST00000483264 487 ntTSL 55.67□□□□□ -1.56e-10■■■□□ 15
TRA2AQ13595 INTS11-223ENST00000498173 1589 ntTSL 220.78■□□□□ 0.921e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.861e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-220ENST00000493534 896 ntTSL 319.26■□□□□ 0.671e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.581e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.561e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-215ENST00000470679 584 ntTSL 518.48■□□□□ 0.551e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-235ENST00000527719 750 ntTSL 518.43■□□□□ 0.541e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-239ENST00000531019 549 ntTSL 418.42■□□□□ 0.541e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-230ENST00000526332 579 ntTSL 418.42■□□□□ 0.541e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-224ENST00000498476 554 ntTSL 418.42■□□□□ 0.541e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-219ENST00000490853 704 ntTSL 318.17■□□□□ 0.51e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.461e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.431e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.421e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-218ENST00000488042 1134 ntTSL 217.31■□□□□ 0.361e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-237ENST00000530031 800 ntTSL 516.99■□□□□ 0.311e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-207ENST00000434694 1056 ntTSL 516.8■□□□□ 0.281e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-232ENST00000526904 551 ntTSL 416.47■□□□□ 0.231e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-221ENST00000496353 2428 ntTSL 216.26■□□□□ 0.191e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-206ENST00000430786 849 ntTSL 515.34■□□□□ 0.051e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-243ENST00000532772 1618 ntTSL 515.29■□□□□ 0.041e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-236ENST00000528879 1524 ntTSL 514.96□□□□□ -0.021e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.081e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-226ENST00000525285 579 ntTSL 414.44□□□□□ -0.11e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-227ENST00000525603 738 ntTSL 314.29□□□□□ -0.121e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.181e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-201ENST00000323275 2450 ntTSL 1 (best)13.88□□□□□ -0.191e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.251e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-229ENST00000526113 591 ntTSL 513.48□□□□□ -0.251e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-244ENST00000532952 773 ntTSL 313.33□□□□□ -0.281e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-233ENST00000527098 2004 ntTSL 213.33□□□□□ -0.281e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-210ENST00000458452 2571 ntTSL 213.24□□□□□ -0.291e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-231ENST00000526797 659 ntTSL 412.49□□□□□ -0.411e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 INTS11-246ENST00000534345 485 ntTSL 411.62□□□□□ -0.551e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 TAF1D-212ENST00000529794 1123 ntTSL 23.76□□□□□ -1.817e-10■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 TAF1D-202ENST00000393259 547 ntTSL 33.6□□□□□ -1.837e-10■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 TAF1D-209ENST00000528734 664 ntTSL 22.7□□□□□ -1.987e-10■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 SETD5-212ENST00000450326 921 ntTSL 315.43■□□□□ 0.061e-17■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.264e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.284e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 TAF1D-218ENST00000533794 505 ntTSL 23.34□□□□□ -1.872e-14■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 TAF1D-221ENST00000540232 483 ntTSL 32.89□□□□□ -1.952e-14■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 HSPA9-213ENST00000524109 1175 ntTSL 510.23□□□□□ -0.777e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.926e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 HSPA9-211ENST00000512328 482 ntTSL 34.11□□□□□ -1.757e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 32.86□□□□□ -1.956e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.095e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 SERGEF-207ENST00000527494 1314 ntTSL 521.23■□□□□ 0.995e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.695e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 CLASRP-208ENST00000587472 345 ntTSL 219.21■□□□□ 0.675e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 CLASRP-214ENST00000591904 506 ntTSL 518.55■□□□□ 0.565e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.535e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.475e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.395e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.285e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.272e-8■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 SERGEF-205ENST00000525422 1525 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.245e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 DKC1-208ENST00000475423 587 ntTSL 216.41■□□□□ 0.225e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.25e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-8■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 YWHAB-203ENST00000428262 648 ntTSL 315.69■□□□□ 0.15e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.065e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 YWHAB-207ENST00000631616 5867 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.015e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 CLASRP-206ENST00000585615 633 ntTSL 215□□□□□ -0.015e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.015e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 CLASRP-210ENST00000588070 445 ntTSL 214.17□□□□□ -0.145e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 CLASRP-202ENST00000391952 2213 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.172e-8■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 KMT2E-203ENST00000334884 6840 ntTSL 513.69□□□□□ -0.224e-8■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.235e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.284e-8■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.334e-8■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.345e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 SERGEF-211ENST00000529440 439 ntTSL 212.9□□□□□ -0.345e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 SERGEF-210ENST00000529151 898 ntTSL 312.9□□□□□ -0.345e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.382e-8■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 SERGEF-221ENST00000532546 833 ntTSL 312.28□□□□□ -0.445e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.495e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.51e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 YWHAB-204ENST00000445830 556 ntTSL 211.81□□□□□ -0.525e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 HNRNPC-206ENST00000553444 724 ntTSL 211.75□□□□□ -0.531e-7■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 CLASRP-216ENST00000592876 751 ntTSL 311.74□□□□□ -0.535e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 SERGEF-206ENST00000525920 497 ntTSL 311.39□□□□□ -0.595e-6■■■□□ 14.9
TRA2AQ13595 ARID1B-201ENST00000319584 2199 ntTSL 211.12□□□□□ -0.635e-6■■■□□ 14.9
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 114.8 ms