Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NEUROD1Q13562 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NEUROD1Q13562 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEUROD1Q13562 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
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