Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TOP3AQ13472 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOP3AQ13472 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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