Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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