Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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