Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF5Q13243 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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