Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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RPA4Q13156 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
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RPA4Q13156 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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RPA4Q13156 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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RPA4Q13156 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPA4Q13156 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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